İlaçların enjeksiyon yolu ile kullanımlarında,enjeksiyon yerinde küçük morluklar ve rahatsızlıklar görülebilir.Burun spreyleri ve cilt altı iğneler ise yorgunluk, kas ve eklem ağrıları ve geçici menopozal yakınmalara benzer şikayetler oluşturabilir. Gonadotropinler,yumurtalıkların aşırı uyarılmalarına neden olabilirler.Bu şekilde ortaya çıkan tabloya " Ovarian Hiperstimulasyon Sendromu denir.Bu durumun çok ciddi şekillerinde hastaneye yatarak tedavi görmeyi gerektiren tıbbi problemler oluşabilir.